Project Structure¶
Auto-generated by scripts/gen_agents_md.py — DO NOT EDIT by hand, run python scripts/gen_agents_md.py to regenerate. Only version-controlled paths are included and large directories are summarized. Contributor instructions remain in AGENTS.md.
├── .claude/
│ ├── hooks/
│ │ └── session-start.sh
│ └── settings.json
├── .config/
│ ├── codespell.ignore
│ └── pre-commit.yaml
├── .github/
│ ├── actions/
│ │ └── checkout-agent-connector-sdk/
│ └── workflows/
│ ├── advisory.yml
│ └── release.yml
├── .kiss/
│ └── kiss.toml
├── .security/
│ ├── authenticated_negative.py
│ ├── repository_fuzz.py
│ └── security-contract.json
├── .specify/
│ └── memory/
│ └── constitution.md
├── agent_utilities/ (63 entries)
├── architecture/
│ └── component-registry.yml
├── deploy/
│ ├── environments/
│ │ ├── dev.yaml
│ │ ├── prod.yaml
│ │ └── test.yaml
│ ├── k8s/
│ │ └── production-cell/
│ ├── loadgen/
│ │ ├── k8s/
│ │ ├── compose.yml
│ │ ├── mock.compose.yml
│ │ ├── README.md
│ │ └── source-registration.schema.json
│ ├── postgres/
│ │ └── tenant_rls.sql
│ ├── release/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── certification-campaign.schema.json
│ │ ├── certification-campaign.yml
│ │ ├── compatibility-matrix.schema.json
│ │ ├── compatibility-matrix.yml
│ │ ├── component-provenance.schema.json
│ │ ├── component-signature-bundle.schema.json
│ │ ├── component-source-evidence.schema.json
│ │ ├── connector-bundle-catalog.schema.json
│ │ ├── connector-bundles.catalog.json
│ │ ├── connector-live-certification-ledger.schema.json
│ │ ├── connector-manifest-signing-job.yaml
│ │ ├── exact-artifact-closure-evidence.schema.json
│ │ ├── exact-local-gates-manifest.schema.json
│ │ ├── exact-local-release-evidence.schema.json
│ │ ├── exact-local-release-spec.schema.json
│ │ ├── index-migration-catalog.schema.json
│ │ ├── index-migrations.catalog.json
│ │ ├── oci-scanner-attestation.schema.json
│ │ ├── oci-vulnerability-database-attestation.schema.json
│ │ ├── oci-vulnerability-scan-evidence.schema.json
│ │ ├── operational-evidence.schema.json
│ │ ├── prebundled-skill-catalog.schema.json
│ │ ├── prebundled-skill-validation-evidence.schema.json
│ │ ├── prebundled-skills.catalog.json
│ │ ├── release-assembly.schema.json
│ │ ├── release-configuration.schema.json
│ │ ├── release-manifest.schema.json
│ │ ├── release-migration-plan.schema.json
│ │ ├── skill-validation-deployment-evidence.schema.json
│ │ ├── skill-validation-deployment.schema.json
│ │ ├── source-freeze-evidence.schema.json
│ │ ├── source-freeze-gates.json
│ │ └── source-freeze-gates.schema.json
│ ├── swarm/
│ │ └── graphos.stack.yml
│ ├── __init__.py
│ ├── action-policy.default.yml
│ ├── mcp-fleet.registry.yml
│ ├── README.md
│ └── schedules.yml
├── docker/
│ ├── paradedb-init/
│ │ └── 01-extensions.sql
│ ├── pg-age/
│ │ └── Dockerfile
│ ├── pg-age-full/
│ │ └── Dockerfile
│ ├── pg-age-init/
│ │ └── 01-extensions.sql
│ ├── recipes/
│ │ └── README.md
│ ├── .env.validation
│ ├── build-job.yaml
│ ├── docker-compose.kafka.yml
│ ├── Dockerfile
│ ├── egeria.compose.yml
│ ├── engine-shards.compose.yml
│ ├── falkordb.compose.yml
│ ├── graphos-unified-kaniko-job.yaml
│ ├── graphos-unified.Dockerfile
│ ├── jena_fuseki.compose.yml
│ ├── kafka-kraft.compose.yml
│ ├── mcp.compose.yml
│ ├── neo4j.compose.yml
│ ├── paradedb.compose.yml
│ ├── pg-age-full.compose.yml
│ ├── pg-age.compose.yml
│ └── README.md
├── docs/ (47 entries)
├── examples/
│ ├── action-policies/
│ │ ├── locked-down.yml
│ │ ├── scoped-autonomous.yml
│ │ └── supervised.yml
│ ├── ontology_workflow/
│ │ ├── compile_process_call.json
│ │ ├── execute_workflow_call.json
│ │ ├── lift_sample_process.py
│ │ └── sample_process.bpmn
│ └── reference_agent/
│ ├── basic_agent.py
│ ├── graph_agent.py
│ ├── knowledge_graph_agent.py
│ ├── mcp_agent.py
│ ├── memory_agent.py
│ ├── protocol_agent.py
│ └── README.md
├── overrides/
│ └── main.html
├── scripts/ (198 entries)
├── specs/
│ ├── _template/
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── agent-context-and-finance/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── agent-control-plane/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── agent-security-policy/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── au-boundary-deconstruction/
│ │ ├── coverage.md
│ │ ├── cutover-matrix.md
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── au-boundary-quality/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── au-developer-environment/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── au-engine-duplicate-retirement/
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── au-integration-reliability/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── au-semantic-client/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── harness-evolution/
│ │ ├── design.md
│ │ ├── evidence.md
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── release-evidence-freeze/
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ ├── retrieval-evaluation/
│ │ ├── plan.md
│ │ ├── spec.md
│ │ ├── status.json
│ │ ├── tasks.md
│ │ └── test-spec.md
│ └── README.md
├── tests/
│ ├── characterization/
│ │ ├── core/
│ │ ├── knowledge_graph/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_branch_merge_state_locker_merge_state.py
│ │ ├── test_check_env_var_drift_ast_helpers.py
│ │ ├── test_cluster_discovery_parse.py
│ │ ├── test_documentation_benchmark_runner.py
│ │ ├── test_emit_trace.py
│ │ ├── test_evolve_agent_manifest_persistence_payload.py
│ │ ├── test_evolve_agent_record_proposed_change.py
│ │ ├── test_graph_configure_characterization.py
│ │ ├── test_graph_ingest_characterization.py
│ │ ├── test_kg_trace_backend_record_event.py
│ │ ├── test_normalize_host_authorities_characterization.py
│ │ ├── test_optimization_request_to_payload.py
│ │ ├── test_provenance_critic_gate_evaluate.py
│ │ ├── test_run_agent_characterization.py
│ │ ├── test_run_analysis_action_characterization.py
│ │ ├── test_run_background_task_dispatch.py
│ │ ├── test_server_factory_configure_auth.py
│ │ ├── test_server_factory_filter_components.py
│ │ └── test_server_factory_network_and_jwt_verifier.py
│ ├── consolidation/
│ │ ├── __snapshots__/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_memory_engine_paths.py
│ │ └── test_router_caps.py
│ ├── contract/
│ │ ├── http/
│ │ └── __init__.py
│ ├── docs/
│ │ ├── __init__.py
│ │ └── test_docs_consistency.py
│ ├── fixtures/
│ │ ├── enterprise/
│ │ ├── relational_authority/
│ │ ├── release/
│ │ ├── scale/
│ │ ├── architecture_graph_search_contract.txt
│ │ ├── rmdd_29_operation_payload.json
│ │ ├── rmdd_29_operation_payload_path_scoped.json
│ │ └── scale_claims_planted_drift.md
│ ├── gates/ (47 entries)
│ ├── harness/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_adaptation_speed.py
│ │ ├── test_always_on_tracing.py
│ │ ├── test_continuous_eval_research_craft_live_path.py
│ │ ├── test_dataset_and_prompt_version.py
│ │ ├── test_edit_engine.py
│ │ ├── test_evaluators.py
│ │ ├── test_evolution_decentralized_memory_live_path.py
│ │ ├── test_evolution_self_play_live_path.py
│ │ ├── test_evolving_memory.py
│ │ ├── test_g_eval.py
│ │ ├── test_judge_calibration.py
│ │ ├── test_kg_trace_backend.py
│ │ ├── test_memorydata_adapter_offline.py
│ │ ├── test_memorydata_bakeoff_cli.py
│ │ ├── test_model_tracing_cache_tokens.py
│ │ ├── test_model_tracing_wrap.py
│ │ ├── test_online_scoring.py
│ │ ├── test_provenance_gate.py
│ │ ├── test_red_team.py
│ │ ├── test_regression_assertions.py
│ │ ├── test_reliability_corpus.py
│ │ ├── test_reliability_scorers.py
│ │ ├── test_remaining_phases_live_path.py
│ │ ├── test_replay_buffer.py
│ │ ├── test_selection_operators.py
│ │ ├── test_skill_memory_adoption.py
│ │ ├── test_stateful_harness.py
│ │ ├── test_superhuman_benchmark.py
│ │ ├── test_swebench_harness.py
│ │ ├── test_swebench_remediation_live_path.py
│ │ ├── test_tool_judge.py
│ │ ├── test_trace_analytics.py
│ │ └── test_tracing.py
│ ├── integration/
│ │ ├── agent/
│ │ ├── backends/
│ │ ├── core/
│ │ ├── graph/
│ │ ├── knowledge_graph/
│ │ ├── mcp/
│ │ ├── orchestration/
│ │ ├── profiles/
│ │ ├── protocols/
│ │ ├── sdd/
│ │ ├── server/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── conftest.py
│ │ ├── test_camunda_live.py
│ │ ├── test_eunomia_integration.py
│ │ ├── test_fleet_chaos.py
│ │ ├── test_full_stack_e2e.py
│ │ ├── test_git_resolver.py
│ │ ├── test_observability_pipeline.py
│ │ ├── test_state_postgres_live.py
│ │ └── test_venv_sync_prune_live.py
│ ├── knowledge_graph/
│ │ ├── core/
│ │ ├── extraction/
│ │ ├── memory/
│ │ ├── research/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_autocut.py
│ │ ├── test_code_health_baseline.py
│ │ ├── test_link_inference.py
│ │ ├── test_native_ingest.py
│ │ ├── test_pack_retrieval_signals.py
│ │ ├── test_relational_intent.py
│ │ ├── test_research_pack.py
│ │ ├── test_schema_pack_audit.py
│ │ └── test_schema_pack_loader.py
│ ├── mcp/
│ │ ├── test_check_env_var_drift.py
│ │ └── test_readme_mcp_examples.py
│ ├── measurement/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_background.py
│ │ ├── test_copy_integrity.py
│ │ ├── test_load_gate.py
│ │ ├── test_merged_tree.py
│ │ ├── test_proc_safety.py
│ │ ├── test_provenance.py
│ │ └── test_run.py
│ ├── ontology/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_action_extension.py
│ │ ├── test_derived_properties.py
│ │ ├── test_document_processing.py
│ │ ├── test_document_processing_bug059.py
│ │ ├── test_edits.py
│ │ ├── test_evidence_spine_media_parity.py
│ │ ├── test_fragment_cited_chunks.py
│ │ ├── test_functions.py
│ │ ├── test_indexing.py
│ │ ├── test_interfaces.py
│ │ ├── test_links.py
│ │ ├── test_object_set.py
│ │ ├── test_ontology_parses.py
│ │ ├── test_permissioning.py
│ │ ├── test_permissioning_external_sync.py
│ │ ├── test_property_types.py
│ │ ├── test_section_tree.py
│ │ ├── test_shacl_gate.py
│ │ ├── test_temporal_shapes.py
│ │ ├── test_value_types.py
│ │ └── test_wave2_live_path.py
│ ├── orchestration/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_durable_run_de1_de3_de5_de6.py
│ │ ├── test_durable_run_replay_determinism.py
│ │ ├── test_durable_run_resume.py
│ │ ├── test_org_runtime.py
│ │ └── test_swe_agent_loop.py
│ ├── research/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_sai_factory.py
│ │ ├── test_sai_factory_tick.py
│ │ └── test_world_model_sai.py
│ ├── retrieval/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_acl_context_compiler_crowd_out.py
│ │ ├── test_adopt_a_context_compiler_acl_crowd_out.py
│ │ ├── test_analytics_job_registry.py
│ │ ├── test_capability_index.py
│ │ ├── test_context_compiler.py
│ │ ├── test_context_compiler_ab_grounding.py
│ │ ├── test_context_compiler_delegated_run_default.py
│ │ ├── test_context_compiler_kv_seam.py
│ │ ├── test_context_compiler_mandatory.py
│ │ ├── test_context_compiler_serving.py
│ │ ├── test_delegation_wiring_live_path.py
│ │ ├── test_direct_corpus.py
│ │ ├── test_executable_rag.py
│ │ ├── test_facade_population.py
│ │ ├── test_hierarchical_document_retriever.py
│ │ ├── test_kg_2_44b_ontology_prior.py
│ │ ├── test_reasoning_reranker.py
│ │ ├── test_retrieval_assimilation_live_path.py
│ │ └── test_reward_writeback.py
│ ├── runtime/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_browser_tier.py
│ │ ├── test_event_protocol.py
│ │ ├── test_policy_adapter.py
│ │ ├── test_provenance_mirror_live_path.py
│ │ ├── test_runtime_api.py
│ │ └── test_workspace_lifecycle.py
│ ├── scale/
│ │ ├── soak/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_capacity_model.py
│ │ ├── test_lazy_cache_bounded.py
│ │ ├── test_live_loadgen_contract.py
│ │ ├── test_prod_profile_guard.py
│ │ └── test_workload_contract.py
│ ├── tools/
│ │ ├── hermetic_harness/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── test_capability_resolver.py
│ │ └── test_code_intelligence_live_path.py
│ ├── unit/ (227 entries)
│ ├── __init__.py
│ ├── _test_engine.py
│ ├── _tmp_path_allocator.py
│ ├── conftest.py
│ ├── kg_recording_backend.py
│ └── wiring.py
├── .bumpversion.cfg
├── .cccc.toml
├── .dockerignore
├── .env.example
├── .gitattributes
├── .gitignore
├── .mergequeue.yaml
├── .repo-layout.toml
├── AGENTS.head.md
├── AGENTS.md
├── build_backend.py
├── CHANGELOG.md
├── CLAUDE.md
├── CONTRIBUTING.md
├── genesis.yaml
├── LICENSE
├── llms.txt
├── MANIFEST.in
├── mcp_config.bus.json
├── mcp_config.example.json
├── mkdocs.yml
├── opencode.json
├── overrides.txt
├── pyproject.toml
├── pytest.ini
├── README.md
├── requirements.txt
├── uv.lock
└── vulture_whitelist.py